Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 CAF40YNL288W 1122 nt5.47□□□□□ -1.53
HER1Q12276 YPL102CYPL102C 303 nt5.47□□□□□ -1.53
HER1Q12276 snR34snR34 203 nt5.47□□□□□ -1.53
HER1Q12276 DIT1YDR403W 1611 nt5.47□□□□□ -1.53
HER1Q12276 YAP1801YHR161C 1914 nt5.46□□□□□ -1.53
HER1Q12276 PTR2YKR093W 1806 nt5.46□□□□□ -1.53
HER1Q12276 SIA1YOR137C 1869 nt5.46□□□□□ -1.54
HER1Q12276 DON1YDR273W 1098 nt5.46□□□□□ -1.54
HER1Q12276 PHB1YGR132C 864 nt5.46□□□□□ -1.54
HER1Q12276 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.46□□□□□ -1.54
HER1Q12276 MPP10YJR002W 1782 nt5.46□□□□□ -1.54
HER1Q12276 TUL1YKL034W 2277 nt5.46□□□□□ -1.54
HER1Q12276 RPS16BYDL083C 432 nt5.45□□□□□ -1.54
HER1Q12276 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.45□□□□□ -1.54
HER1Q12276 COX20YDR231C 618 nt5.45□□□□□ -1.54
HER1Q12276 DJP1YIR004W 1299 nt5.45□□□□□ -1.54
HER1Q12276 SCP1YOR367W 603 nt5.45□□□□□ -1.54
HER1Q12276 YPR098CYPR098C 486 nt5.45□□□□□ -1.54
HER1Q12276 SUE1YPR151C 621 nt5.45□□□□□ -1.54
HER1Q12276 ASF2YDL197C 1578 nt5.45□□□□□ -1.54
HER1Q12276 APE1YKL103C 1545 nt5.44□□□□□ -1.54
HER1Q12276 VBA1YMR088C 1689 nt5.44□□□□□ -1.54
HER1Q12276 ASP1YDR321W 1146 nt5.44□□□□□ -1.54
HER1Q12276 URA3YEL021W 804 nt5.44□□□□□ -1.54
HER1Q12276 ISY1YJR050W 708 nt5.44□□□□□ -1.54
HER1Q12276 YKL031WYKL031W 414 nt5.44□□□□□ -1.54
HER1Q12276 HOF1YMR032W 2010 nt5.44□□□□□ -1.54
HER1Q12276 JNM1YMR294W 1122 nt5.44□□□□□ -1.54
HER1Q12276 MTF2YDL044C 1323 nt5.44□□□□□ -1.54
HER1Q12276 YMD8YML038C 1329 nt5.44□□□□□ -1.54
HER1Q12276 ISR1YPR106W 1332 nt5.44□□□□□ -1.54
HER1Q12276 UGO1YDR470C 1509 nt5.43□□□□□ -1.54
HER1Q12276 EAF5YEL018W 840 nt5.43□□□□□ -1.54
HER1Q12276 YEL077CYEL077C 3834 nt5.43□□□□□ -1.54
HER1Q12276 DOT5YIL010W 648 nt5.43□□□□□ -1.54
HER1Q12276 YIL060WYIL060W 435 nt5.43□□□□□ -1.54
HER1Q12276 YNL228WYNL228W 777 nt5.43□□□□□ -1.54
HER1Q12276 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.43□□□□□ -1.54
HER1Q12276 SRV2YNL138W 1581 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 MAD2YJL030W 591 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 YJR115WYJR115W 510 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 RPS5YJR123W 678 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 DBR1YKL149C 1218 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 ECM19YLR390W 339 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 SPC24YMR117C 642 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 ELA1YNL230C 1140 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 PDR16YNL231C 1056 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 YPL168WYPL168W 1293 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 ENV7YPL236C 1095 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 CST6YIL036W 1764 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 PRP40YKL012W 1752 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 GAS3YMR215W 1575 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 PDH1YPR002W 1551 nt5.42□□□□□ -1.54
HER1Q12276 FLC3YGL139W 2409 nt5.41□□□□□ -1.54
HER1Q12276 MDH3YDL078C 1032 nt5.41□□□□□ -1.54
HER1Q12276 UPS3YDR185C 540 nt5.41□□□□□ -1.54
HER1Q12276 PRS1YKL181W 1284 nt5.41□□□□□ -1.54
HER1Q12276 PGA2YNL149C 390 nt5.41□□□□□ -1.54
HER1Q12276 OXP1YKL215C 3861 nt5.4□□□□□ -1.54
HER1Q12276 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.4□□□□□ -1.54
HER1Q12276 SKI6YGR195W 741 nt5.4□□□□□ -1.54
HER1Q12276 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.4□□□□□ -1.54
HER1Q12276 TIF34YMR146C 1044 nt5.4□□□□□ -1.54
HER1Q12276 SHP1YBL058W 1272 nt5.4□□□□□ -1.54
HER1Q12276 PHA2YNL316C 1005 nt5.4□□□□□ -1.54
HER1Q12276 CKA2YOR061W 1020 nt5.4□□□□□ -1.54
HER1Q12276 ELC1YPL046C 300 nt5.4□□□□□ -1.54
HER1Q12276 GPI18YBR004C 1302 nt5.4□□□□□ -1.55
HER1Q12276 WHI4YDL224C 1950 nt5.4□□□□□ -1.55
HER1Q12276 RAD24YER173W 1980 nt5.4□□□□□ -1.55
HER1Q12276 UTP4YDR324C 2331 nt5.4□□□□□ -1.55
HER1Q12276 SEC12YNR026C 1416 nt5.4□□□□□ -1.55
HER1Q12276 MAL11YGR289C 1851 nt5.39□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YDL129WYDL129W 876 nt5.39□□□□□ -1.55
HER1Q12276 MMS2YGL087C 414 nt5.39□□□□□ -1.55
HER1Q12276 BUD32YGR262C 786 nt5.39□□□□□ -1.55
HER1Q12276 GCV3YAL044C 513 nt5.39□□□□□ -1.55
HER1Q12276 SED5YLR026C 1023 nt5.39□□□□□ -1.55
HER1Q12276 MLC2YPR188C 492 nt5.39□□□□□ -1.55
HER1Q12276 RPT2YDL007W 1314 nt5.39□□□□□ -1.55
HER1Q12276 ECM3YOR092W 1842 nt5.39□□□□□ -1.55
HER1Q12276 SKS1YPL026C 1509 nt5.38□□□□□ -1.55
HER1Q12276 DBF2YGR092W 1719 nt5.38□□□□□ -1.55
HER1Q12276 SEC13YLR208W 894 nt5.38□□□□□ -1.55
HER1Q12276 MID2YLR332W 1131 nt5.38□□□□□ -1.55
HER1Q12276 SPG4YMR107W 348 nt5.38□□□□□ -1.55
HER1Q12276 ADD37YMR184W 597 nt5.38□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.38□□□□□ -1.55
HER1Q12276 FES1YBR101C 873 nt5.38□□□□□ -1.55
HER1Q12276 RGT1YKL038W 3513 nt5.38□□□□□ -1.55
HER1Q12276 CLB4YLR210W 1383 nt5.38□□□□□ -1.55
HER1Q12276 DFG5YMR238W 1377 nt5.38□□□□□ -1.55
HER1Q12276 RNR3YIL066C 2610 nt5.38□□□□□ -1.55
HER1Q12276 NRD1YNL251C 1728 nt5.37□□□□□ -1.55
HER1Q12276 SEC20YDR498C 1152 nt5.37□□□□□ -1.55
HER1Q12276 MTC2YKL098W 1074 nt5.37□□□□□ -1.55
HER1Q12276 YLR036CYLR036C 612 nt5.37□□□□□ -1.55
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