Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 VMS1YDR049W 1899 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 GPT2YKR067W 2232 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 ENT2YLR206W 1842 nt5.54□□□□□ -1.52 RIP-Chip
PUF2Q12221 PRO3YER023W 861 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 YKL151CYKL151C 1014 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 ALT1YLR089C 1779 nt5.54□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 CLB2YPR119W 1476 nt5.53□□□□□ -1.52 RIP-Chip
PUF2Q12221 BZZ1YHR114W 1902 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 SFC1YJR095W 969 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 UBC4YBR082C 447 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 YPR195CYPR195C 330 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 DED81YHR019C 1665 nt5.53□□□□□ -1.52
PUF2Q12221 CHO1YER026C 831 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 TDH3YGR192C 999 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 LSM12YHR121W 564 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 YHR127WYHR127W 732 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 YNL234WYNL234W 1281 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 YOR318CYOR318C 306 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 CWC27YPL064C 906 nt5.52□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF2Q12221 MRP51YPL118W 1035 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 CBC2YPL178W 627 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 KTR3YBR205W 1215 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 TAX4YJL083W 1815 nt5.52□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF2Q12221 YMR155WYMR155W 1644 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 TKL1YPR074C 2043 nt5.52□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 GEP3YOR205C 1671 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 MTQ2YDR140W 666 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 SLO1YER180C-A 258 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 YFL064CYFL064C 525 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 SOH1YGL127C 384 nt5.51□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF2Q12221 YJU2YKL095W 837 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 PFA3YNL326C 1011 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 YOL079WYOL079W 399 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 YPR202WYPR202W 717 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 CRZ1YNL027W 2037 nt5.51□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF2Q12221 PHO8YDR481C 1701 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 TOS4YLR183C 1470 nt5.51□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 ATG18YFR021W 1503 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 MTQ1YNL063W 945 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 HAL1YPR005C 885 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 NOP7YGR103W 1818 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 FAT3YKL187C 2253 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 PPR1YLR014C 2715 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 RMD9YGL107C 1941 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 YBR138CYBR138C 1575 nt5.5□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 DIT1YDR403W 1611 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 GEX1YCL073C 1848 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 GEX2YKR106W 1848 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 SNF11YDR073W 510 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 MPC1YGL080W 393 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 SEC13YLR208W 894 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 ODC2YOR222W 924 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 ELC1YPL046C 300 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 CTR1YPR124W 1221 nt5.49□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF2Q12221 CLB4YLR210W 1383 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 NOB1YOR056C 1380 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 MMP1YLL061W 1752 nt5.49□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 RPN5YDL147W 1338 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 SVF1YDR346C 1446 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 ADE13YLR359W 1449 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 YGR182CYGR182C 354 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 VMA16YHR026W 642 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 HSP150YJL159W 1242 nt5.48□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF2Q12221 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 YCL041CYCL041C 495 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 ECM7YLR443W 1347 nt5.48□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 ESC8YOL017W 2145 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 YGR291CYGR291C 222 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 GON7YJL184W 372 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 ALG5YPL227C 1005 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.47□□□□□ -1.53
PUF2Q12221 RCK1YGL158W 1539 nt5.47□□□□□ -1.53 RIP-Chip
PUF2Q12221 UTP9YHR196W 1728 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 YDR541CYDR541C 1035 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 RAI1YGL246C 1164 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 LDB18YLL049W 540 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 PHA2YNL316C 1005 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 PSH1YOL054W 1221 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 SAM4YPL273W 978 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 RRT2YBR246W 1164 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 SOG2YOR353C 2376 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 YJR015WYJR015W 1533 nt5.46□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 GUS1YGL245W 2127 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 UTP18YJL069C 1785 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 YGL036WYGL036W 2730 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 GET3YDL100C 1065 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 SUA5YGL169W 1281 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 YKR073CYKR073C 321 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 ERG3YLR056W 1098 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 GEP5YLR091W 882 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 YLR283WYLR283W 945 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 YNL228WYNL228W 777 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 ROX3YBL093C 663 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 NDJ1YOL104C 1059 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 GPI18YBR004C 1302 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 BSC5YNR069C 1470 nt5.45□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 SIP2YGL208W 1248 nt5.44□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 SCW4YGR279C 1161 nt5.44□□□□□ -1.54
PUF2Q12221 SET5YHR207C 1581 nt5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.4 ms