Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 TAH18YPR048W 1872 nt6.58□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 NSA1YGL111W 1392 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 CMR1YDL156W 1569 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 EXG1YLR300W 1347 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 KAR5YMR065W 1515 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YML133CYML133C 4125 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 BUG1YDL099W 1026 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 HSP31YDR533C 714 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 ERG26YGL001C 1050 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YNG2YHR090C 849 nt6.57□□□□□ -1.36 RIP-Chip
PUF3Q07807 MPC2YHR162W 390 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YUR1YJL139C 1287 nt6.57□□□□□ -1.36 RIP-Chip
PUF3Q07807 TPK1YJL164C 1194 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 AAT2YLR027C 1257 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YMR178WYMR178W 825 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YMR252CYMR252C 405 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 SCS7YMR272C 1155 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 RPS3YNL178W 723 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 ODC2YOR222W 924 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 ELC1YPL046C 300 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 BSC5YNR069C 1470 nt6.57□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 SLX5YDL013W 1860 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 AMD2YDR242W 1650 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 RAD59YDL059C 717 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 NSE3YDR288W 912 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YMR187CYMR187C 1296 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 RFM1YOR279C 933 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 SMA1YPL027W 738 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 SGF29YCL010C 780 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 OSW2YLR054C 2175 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 OPT1YJL212C 2400 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 ILV1YER086W 1731 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 HSE1YHL002W 1359 nt6.56□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 MKK1YOR231W 1527 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 NSE5YML023C 1671 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 MPA43YNL249C 1629 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 OPI7YDR360W 435 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 STE2YFL026W 1296 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 TFG2YGR005C 1203 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 COA1YIL157C 594 nt6.55□□□□□ -1.36 RIP-Chip
PUF3Q07807 YKL202WYKL202W 582 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 BUD21YOR078W 645 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YOR097CYOR097C 528 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 TED1YIL039W 1422 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 HXT15YDL245C 1704 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 HXT16YJR158W 1704 nt6.55□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 CNM67YNL225C 1746 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 HEM3YDL205C 984 nt6.54□□□□□ -1.36 RIP-Chip
PUF3Q07807 HTB1YDR224C 396 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 AAD6YFL056C 639 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YGL214WYGL214W 486 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 COG2YGR120C 789 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 POL32YJR043C 1053 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YLR379WYLR379W 375 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YMR122CYMR122C 375 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 JID1YPR061C 906 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 RPL21AYBR191W 483 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 CHL4YDR254W 1377 nt6.54□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 NHA1YLR138W 2958 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 SDH4YDR178W 546 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 SPO11YHL022C 1197 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 PAN5YHR063C 1140 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 YIR042CYIR042C 711 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 ROT1YMR200W 771 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 AAH1YNL141W 1044 nt6.53□□□□□ -1.36
PUF3Q07807 ABD1YBR236C 1311 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 RRG1YDR065W 1098 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 MRPL1YDR116C 858 nt6.52□□□□□ -1.37 RIP-Chip
PUF3Q07807 TDH2YJR009C 999 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 RSM26YJR101W 801 nt6.52□□□□□ -1.37 RIP-Chip
PUF3Q07807 EFM3YJR129C 1020 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 MDH1YKL085W 1005 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 MMM1YLL006W 1281 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 PSR2YLR019W 1194 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 DUS4YLR405W 1104 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 ARG8YOL140W 1272 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 SUI3YPL237W 858 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 LDB17YDL146W 1476 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 CDC1YDR182W 1476 nt6.52□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 GEF1YJR040W 2340 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 RAV2YDR202C 1056 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 GPI11YDR302W 660 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 GIC2YDR309C 1152 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 TMT1YER175C 900 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YGL177WYGL177W 348 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 CLC1YGR167W 702 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YMR245WYMR245W 621 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YOL106WYOL106W 354 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 IPP1YBR011C 864 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 YBR013CYBR013C 390 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 TEC1YBR083W 1461 nt6.51□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 RVB2YPL235W 1416 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 TKL2YBR117C 2046 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 MCH1YDL054C 1461 nt6.5□□□□□ -1.37
PUF3Q07807 SRG1SRG1 551 nt6.5□□□□□ -1.37
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