Protein–RNA interactions for Protein: Q00723

PRP38, Pre-mRNA-splicing factor 38, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP38Q00723 PGU1YJR153W 1086 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 MRPL15YLR312W-A 762 nt5.25□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 MNN2YBR015C 1794 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 YDL034WYDL034W 345 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 EFM4YIL064W 774 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 YLL059CYLL059C 507 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 DCN1YLR128W 810 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 ERI1YPL096C-A 207 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 BRF1YGR246C 1791 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 SIA1YOR137C 1869 nt5.24□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 DPH2YKL191W 1605 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 GCS1YDL226C 1059 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 YHR045WYHR045W 1683 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 PPR1YLR014C 2715 nt5.23□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 ABZ1YNR033W 2364 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 ADY2YCR010C 852 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 SYN8YAL014C 768 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 YJL211CYJL211C 444 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 TFS1YLR178C 660 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 DAL82YNL314W 768 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 CPA1YOR303W 1236 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.22□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 DBP9YLR276C 1785 nt5.21□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 HAP1YLR256W 4509 nt5.21□□□□□ -1.57
PRP38Q00723 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.21□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 ARP1YHR129C 1155 nt5.21□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 SWP1YMR149W 861 nt5.21□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 ELA1YNL230C 1140 nt5.21□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 OST3YOR085W 1053 nt5.21□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.21□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 VAN1YML115C 1608 nt5.21□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 QDR1YIL120W 1692 nt5.21□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 ASF2YDL197C 1578 nt5.21□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 TAX4YJL083W 1815 nt5.2□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 VHS1YDR247W 1386 nt5.2□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 BNA5YLR231C 1362 nt5.2□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 CST6YIL036W 1764 nt5.2□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 CAD1YDR423C 1230 nt5.2□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 DAL3YIR032C 588 nt5.2□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 MTW1YAL034W-A 870 nt5.2□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 RPS19BYNL302C 435 nt5.2□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 LEM3YNL323W 1245 nt5.2□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 GPM3YOL056W 912 nt5.2□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 QRI1YDL103C 1434 nt5.2□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 ATG7YHR171W 1893 nt5.2□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 NUD1YOR373W 2556 nt5.19□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 EEB1YPL095C 1371 nt5.19□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 YFL034WYFL034W 3222 nt5.19□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 COS9YKL219W 1224 nt5.19□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 ARG1YOL058W 1263 nt5.19□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 ENV9YOR246C 993 nt5.19□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 RTT106YNL206C 1368 nt5.18□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 ORM1YGR038W 669 nt5.18□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 YLR296WYLR296W 327 nt5.18□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 RPT2YDL007W 1314 nt5.18□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 NPL6YMR091C 1308 nt5.18□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 ULA1YPL003W 1389 nt5.17□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 KIP2YPL155C 2121 nt5.17□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 SCW4YGR279C 1161 nt5.17□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 SPG4YMR107W 348 nt5.17□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 ROX3YBL093C 663 nt5.17□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.17□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 ODC2YOR222W 924 nt5.17□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 STE50YCL032W 1041 nt5.17□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 OXP1YKL215C 3861 nt5.17□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 CTS2YDR371W 1536 nt5.17□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 YGL036WYGL036W 2730 nt5.17□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 DFG5YMR238W 1377 nt5.16□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 ARP2YDL029W 1176 nt5.16□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 SSY5YJL156C 2100 nt5.16□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 PDR16YNL231C 1056 nt5.16□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 MET7YOR241W 1647 nt5.15□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 NSI1YDR026C 1713 nt5.15□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 NRD1YNL251C 1728 nt5.15□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 DAK1YML070W 1755 nt5.15□□□□□ -1.58
PRP38Q00723 YJR115WYJR115W 510 nt5.15□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 YOR024WYOR024W 324 nt5.15□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 SCO1YBR037C 888 nt5.15□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 RAD53YPL153C 2466 nt5.15□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 ATE1YGL017W 1512 nt5.14□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 MLC1YGL106W 450 nt5.14□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 RPA49YNL248C 1248 nt5.14□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 YIR007WYIR007W 2295 nt5.14□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 TOS4YLR183C 1470 nt5.13□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 ROG3YFR022W 2202 nt5.13□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 BPL1YDL141W 2073 nt5.13□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 RML2YEL050C 1182 nt5.13□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 YLR118CYLR118C 684 nt5.13□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 SYG1YIL047C 2709 nt5.13□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 GDB1YPR184W 4611 nt5.12□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 VPS72YDR485C 2388 nt5.12□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 YFL064CYFL064C 525 nt5.12□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 YJL107CYJL107C 1164 nt5.12□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 CAR1YPL111W 1002 nt5.12□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 CBC2YPL178W 627 nt5.12□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 YPR202WYPR202W 717 nt5.12□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 ENP1YBR247C 1452 nt5.12□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 RGT1YKL038W 3513 nt5.11□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 YGR182CYGR182C 354 nt5.11□□□□□ -1.59
PRP38Q00723 YJL193WYJL193W 1209 nt5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.2 ms