Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4A3P38919 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4A3P38919 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms