Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5A1P25705 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5A1P25705 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5A1P25705 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5A1P25705 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5A1P25705 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP5A1P25705 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP5A1P25705 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms