Protein–RNA interactions for Protein: P22459

KCNA4, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA4P22459 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNA4P22459 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 SMIM26-201ENST00000411646 505 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNA4P22459 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNA4P22459 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms