Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHGAP10645 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CHGAP10645 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHGAP10645 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHGAP10645 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHGAP10645 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHGAP10645 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CHGAP10645 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHGAP10645 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHGAP10645 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHGAP10645 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHGAP10645 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHGAP10645 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CHGAP10645 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHGAP10645 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHGAP10645 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHGAP10645 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CHGAP10645 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHGAP10645 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHGAP10645 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHGAP10645 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHGAP10645 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHGAP10645 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHGAP10645 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CHGAP10645 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHGAP10645 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHGAP10645 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHGAP10645 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHGAP10645 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHGAP10645 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHGAP10645 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHGAP10645 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHGAP10645 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHGAP10645 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CHGAP10645 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHGAP10645 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHGAP10645 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHGAP10645 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHGAP10645 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CHGAP10645 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CHGAP10645 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CHGAP10645 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHGAP10645 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHGAP10645 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHGAP10645 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHGAP10645 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHGAP10645 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHGAP10645 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHGAP10645 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHGAP10645 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHGAP10645 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CHGAP10645 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CHGAP10645 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CHGAP10645 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHGAP10645 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CHGAP10645 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHGAP10645 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHGAP10645 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHGAP10645 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHGAP10645 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHGAP10645 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CHGAP10645 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHGAP10645 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CHGAP10645 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHGAP10645 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CHGAP10645 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CHGAP10645 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CHGAP10645 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHGAP10645 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CHGAP10645 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CHGAP10645 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CHGAP10645 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHGAP10645 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CHGAP10645 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CHGAP10645 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CHGAP10645 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CHGAP10645 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHGAP10645 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CHGAP10645 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CHGAP10645 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CHGAP10645 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CHGAP10645 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CHGAP10645 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHGAP10645 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CHGAP10645 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHGAP10645 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHGAP10645 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CHGAP10645 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CHGAP10645 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHGAP10645 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHGAP10645 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHGAP10645 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHGAP10645 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHGAP10645 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CHGAP10645 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CHGAP10645 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CHGAP10645 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHGAP10645 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHGAP10645 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHGAP10645 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms