Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HLA-DOAP06340 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HLA-DOAP06340 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HLA-DOAP06340 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms