Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC11O43248 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC11O43248 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC11O43248 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC11O43248 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC11O43248 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC11O43248 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC11O43248 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC11O43248 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXC11O43248 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC11O43248 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms