Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DFFAO00273 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DFFAO00273 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DFFAO00273 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DFFAO00273 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DFFAO00273 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DFFAO00273 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DFFAO00273 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DFFAO00273 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DFFAO00273 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DFFAO00273 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DFFAO00273 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DFFAO00273 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DFFAO00273 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DFFAO00273 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DFFAO00273 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DFFAO00273 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DFFAO00273 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DFFAO00273 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DFFAO00273 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DFFAO00273 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DFFAO00273 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DFFAO00273 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DFFAO00273 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DFFAO00273 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DFFAO00273 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DFFAO00273 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DFFAO00273 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DFFAO00273 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DFFAO00273 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DFFAO00273 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DFFAO00273 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DFFAO00273 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DFFAO00273 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DFFAO00273 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DFFAO00273 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DFFAO00273 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DFFAO00273 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DFFAO00273 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DFFAO00273 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DFFAO00273 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DFFAO00273 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DFFAO00273 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DFFAO00273 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DFFAO00273 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DFFAO00273 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DFFAO00273 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DFFAO00273 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DFFAO00273 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DFFAO00273 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DFFAO00273 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DFFAO00273 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DFFAO00273 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DFFAO00273 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DFFAO00273 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DFFAO00273 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DFFAO00273 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DFFAO00273 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DFFAO00273 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DFFAO00273 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DFFAO00273 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DFFAO00273 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DFFAO00273 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DFFAO00273 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DFFAO00273 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DFFAO00273 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DFFAO00273 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DFFAO00273 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DFFAO00273 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DFFAO00273 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DFFAO00273 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DFFAO00273 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DFFAO00273 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DFFAO00273 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DFFAO00273 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DFFAO00273 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DFFAO00273 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DFFAO00273 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DFFAO00273 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DFFAO00273 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DFFAO00273 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DFFAO00273 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DFFAO00273 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DFFAO00273 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DFFAO00273 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DFFAO00273 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DFFAO00273 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DFFAO00273 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DFFAO00273 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DFFAO00273 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DFFAO00273 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DFFAO00273 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DFFAO00273 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DFFAO00273 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DFFAO00273 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DFFAO00273 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DFFAO00273 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DFFAO00273 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DFFAO00273 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DFFAO00273 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms