Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBC2A0A5B9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBC2A0A5B9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBC2A0A5B9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBC2A0A5B9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC2A0A5B9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC2A0A5B9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC2A0A5B9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC2A0A5B9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC2A0A5B9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBC2A0A5B9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRBC2A0A5B9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRBC2A0A5B9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBC2A0A5B9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBC2A0A5B9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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