Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPNE7Q9UBL6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPNE7Q9UBL6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPNE7Q9UBL6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.2 ms