Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTR3BQ9P1U1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTR3BQ9P1U1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTR3BQ9P1U1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms