Protein–RNA interactions for Protein: Q9H305

CDIP1, Cell death-inducing p53-target protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIP1Q9H305 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDIP1Q9H305 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDIP1Q9H305 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDIP1Q9H305 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms