Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ6

CHRNA10, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-10, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA10Q9GZZ6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNA10Q9GZZ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA10Q9GZZ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA10Q9GZZ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA10Q9GZZ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA10Q9GZZ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA10Q9GZZ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA10Q9GZZ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA10Q9GZZ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA10Q9GZZ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA10Q9GZZ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA10Q9GZZ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA10Q9GZZ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA10Q9GZZ6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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