Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNHG12Q9BXW3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SNHG12Q9BXW3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNHG12Q9BXW3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms