Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRA6Q9BX79 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
STRA6Q9BX79 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
STRA6Q9BX79 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRA6Q9BX79 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms