Protein–RNA interactions for Protein: Q96M34

C3orf30, Uncharacterized protein C3orf30, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf30Q96M34 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
C3orf30Q96M34 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C3orf30Q96M34 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C3orf30Q96M34 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C3orf30Q96M34 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf30Q96M34 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C3orf30Q96M34 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms