Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00612Q8N6U2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00612Q8N6U2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms