Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCOLCEQ15113 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCOLCEQ15113 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PCOLCEQ15113 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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