Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PSME1Q06323 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PSME1Q06323 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PSME1Q06323 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PSME1Q06323 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms