Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMX1Q04741 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EMX1Q04741 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EMX1Q04741 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms