Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIK1P57059 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIK1P57059 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SIK1P57059 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIK1P57059 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIK1P57059 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIK1P57059 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIK1P57059 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIK1P57059 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIK1P57059 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIK1P57059 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIK1P57059 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SIK1P57059 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIK1P57059 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIK1P57059 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIK1P57059 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIK1P57059 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIK1P57059 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIK1P57059 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SIK1P57059 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIK1P57059 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIK1P57059 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIK1P57059 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SIK1P57059 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIK1P57059 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIK1P57059 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIK1P57059 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIK1P57059 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIK1P57059 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIK1P57059 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SIK1P57059 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIK1P57059 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIK1P57059 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIK1P57059 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIK1P57059 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIK1P57059 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIK1P57059 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIK1P57059 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIK1P57059 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIK1P57059 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SIK1P57059 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
SIK1P57059 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIK1P57059 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIK1P57059 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIK1P57059 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIK1P57059 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIK1P57059 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIK1P57059 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIK1P57059 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIK1P57059 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SIK1P57059 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIK1P57059 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIK1P57059 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIK1P57059 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIK1P57059 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIK1P57059 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SIK1P57059 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIK1P57059 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIK1P57059 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIK1P57059 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SIK1P57059 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SIK1P57059 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIK1P57059 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SIK1P57059 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIK1P57059 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIK1P57059 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SIK1P57059 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIK1P57059 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SIK1P57059 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIK1P57059 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIK1P57059 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIK1P57059 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIK1P57059 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIK1P57059 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SIK1P57059 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIK1P57059 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIK1P57059 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIK1P57059 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIK1P57059 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SIK1P57059 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIK1P57059 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIK1P57059 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIK1P57059 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIK1P57059 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
SIK1P57059 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SIK1P57059 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIK1P57059 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SIK1P57059 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIK1P57059 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIK1P57059 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIK1P57059 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SIK1P57059 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SIK1P57059 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIK1P57059 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIK1P57059 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SIK1P57059 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIK1P57059 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIK1P57059 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SIK1P57059 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SIK1P57059 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms