Protein–RNA interactions for Protein: P55347

PKNOX1, Homeobox protein PKNOX1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1P55347 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PKNOX1P55347 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKNOX1P55347 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms