Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAD23AP54725 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAD23AP54725 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAD23AP54725 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms