Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACLYP53396 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACLYP53396 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACLYP53396 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACLYP53396 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACLYP53396 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACLYP53396 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACLYP53396 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACLYP53396 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACLYP53396 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACLYP53396 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACLYP53396 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACLYP53396 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACLYP53396 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACLYP53396 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACLYP53396 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACLYP53396 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACLYP53396 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACLYP53396 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ACLYP53396 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACLYP53396 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACLYP53396 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACLYP53396 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACLYP53396 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ACLYP53396 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ACLYP53396 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ACLYP53396 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACLYP53396 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACLYP53396 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACLYP53396 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACLYP53396 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ACLYP53396 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACLYP53396 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACLYP53396 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACLYP53396 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACLYP53396 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACLYP53396 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ACLYP53396 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACLYP53396 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACLYP53396 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACLYP53396 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACLYP53396 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACLYP53396 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ACLYP53396 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACLYP53396 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACLYP53396 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ACLYP53396 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ACLYP53396 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACLYP53396 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ACLYP53396 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACLYP53396 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACLYP53396 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACLYP53396 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACLYP53396 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ACLYP53396 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACLYP53396 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACLYP53396 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACLYP53396 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACLYP53396 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACLYP53396 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACLYP53396 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACLYP53396 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACLYP53396 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACLYP53396 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACLYP53396 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACLYP53396 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACLYP53396 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ACLYP53396 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACLYP53396 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACLYP53396 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACLYP53396 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACLYP53396 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ACLYP53396 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACLYP53396 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACLYP53396 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ACLYP53396 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACLYP53396 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACLYP53396 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACLYP53396 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ACLYP53396 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACLYP53396 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACLYP53396 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACLYP53396 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACLYP53396 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ACLYP53396 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACLYP53396 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ACLYP53396 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ACLYP53396 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACLYP53396 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACLYP53396 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACLYP53396 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACLYP53396 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACLYP53396 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACLYP53396 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACLYP53396 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACLYP53396 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACLYP53396 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ACLYP53396 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACLYP53396 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACLYP53396 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms