Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSRP3P50461 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSRP3P50461 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSRP3P50461 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSRP3P50461 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms