Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2CP19387 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2CP19387 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2CP19387 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms