Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNIP3LO60238 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BNIP3LO60238 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms