Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms