Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 HPN-205ENST00000596662 584 ntTSL 415.1■□□□□ 0.012e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-215ENST00000510074 649 ntTSL 515.09■□□□□ 0.012e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-219ENST00000511237 517 ntTSL 515.09■□□□□ 0.012e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-203ENST00000412521 586 ntTSL 414.87□□□□□ -0.032e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-211ENST00000506932 537 ntTSL 414.84□□□□□ -0.032e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SRC-210ENST00000493775 559 ntTSL 414.56□□□□□ -0.082e-12■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ITGB5-208ENST00000483168 576 ntTSL 414.26□□□□□ -0.132e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 TIMM10B-202ENST00000528908 593 ntTSL 1 (best)14.24□□□□□ -0.133e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 PEG3-207ENST00000599534 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.154e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-208ENST00000504294 557 ntTSL 513.95□□□□□ -0.182e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-213ENST00000508385 876 ntTSL 313.86□□□□□ -0.192e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-210ENST00000439297 569 ntTSL 413.62□□□□□ -0.232e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-226ENST00000513095 609 ntTSL 413.43□□□□□ -0.262e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF331-211ENST00000509047 670 ntTSL 313.3□□□□□ -0.282e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-215ENST00000453773 498 ntTSL 413.17□□□□□ -0.32e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-205ENST00000502260 727 ntTSL 313.1□□□□□ -0.312e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.332e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SRC-207ENST00000477066 3300 ntTSL 212.94□□□□□ -0.342e-12■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-202ENST00000412064 1044 ntTSL 512.93□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-211ENST00000439963 625 ntTSL 412.93□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.363e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-203ENST00000371674 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF331-208ENST00000504940 350 ntTSL 312.5□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 TIMM10B-201ENST00000254616 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.483e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-222ENST00000512014 688 ntTSL 312.03□□□□□ -0.482e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ITGB5-204ENST00000465464 1164 ntTSL 511.66□□□□□ -0.542e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 TIMM10B-203ENST00000530751 809 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.553e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SETD5-211ENST00000443339 3478 ntTSL 211.39□□□□□ -0.592e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SH3BP2-224ENST00000513020 868 ntTSL 311.35□□□□□ -0.592e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF331-213ENST00000509585 562 ntTSL 511.34□□□□□ -0.592e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-208ENST00000432753 561 ntTSL 411.3□□□□□ -0.62e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-206ENST00000415862 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 AC084337.2-202ENST00000640959 595 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.683e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 TIMM10B-205ENST00000533379 608 ntTSL 210.63□□□□□ -0.713e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 AC084337.2-201ENST00000639224 589 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.42□□□□□ -0.743e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF331-204ENST00000502248 670 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.752e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-207ENST00000426184 565 ntTSL 410.18□□□□□ -0.782e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-220ENST00000475509 590 ntTSL 510.03□□□□□ -0.82e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 POR-204ENST00000414186 548 ntTSL 410□□□□□ -0.812e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SETD5-201ENST00000302463 4786 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.852e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-217ENST00000486653 563 ntTSL 49.6□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-205ENST00000396059 1983 ntTSL 1 (best)9.28□□□□□ -0.922e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 TIMM10B-204ENST00000531462 516 ntTSL 39.14□□□□□ -0.953e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ITGB5-212ENST00000608657 825 ntTSL 38.86□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -12e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SETD5-208ENST00000421188 1323 ntTSL 58.74□□□□□ -1.012e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF331-216ENST00000511593 1985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.022e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.051e-9■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF189-202ENST00000339664 3021 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.14e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.152e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SETD5-225ENST00000488236 1320 ntTSL 57.85□□□□□ -1.152e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.162e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 FNDC3B-206ENST00000443501 678 ntTSL 37.6□□□□□ -1.193e-15■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SETD5-206ENST00000413704 3428 ntTSL 27.56□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF331-222ENST00000514374 574 ntTSL 47.56□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SETD5-228ENST00000493918 4861 ntTSL 1 (best)7.4□□□□□ -1.232e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-211ENST00000467839 566 ntTSL 26.75□□□□□ -1.332e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-216ENST00000483534 1155 ntTSL 1 (best)6.75□□□□□ -1.332e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SETD5-217ENST00000466242 4038 ntTSL 26.68□□□□□ -1.342e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 FNDC3B-208ENST00000476794 682 ntTSL 36.11□□□□□ -1.433e-15■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.444e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-208ENST00000432266 569 ntTSL 45.82□□□□□ -1.482e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SETD5-220ENST00000476740 584 ntTSL 35.4□□□□□ -1.542e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-221ENST00000493090 563 ntTSL 44.93□□□□□ -1.622e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-219ENST00000490555 549 ntTSL 44.68□□□□□ -1.662e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 PRKAB2-203ENST00000496858 601 ntTSL 34.49□□□□□ -1.693e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-220ENST00000492371 535 ntTSL 34.34□□□□□ -1.712e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 MAT2A-206ENST00000490878 565 ntTSL 33.78□□□□□ -1.84e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 FNDC3B-209ENST00000478016 554 ntTSL 43.45□□□□□ -1.863e-15■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBR4-215ENST00000492606 314 ntTSL 33.35□□□□□ -1.871e-9■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 UBE2V1-214ENST00000472923 421 ntTSL 53.33□□□□□ -1.882e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 SETD5-222ENST00000478961 672 ntTSL 22.55□□□□□ -22e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.075e-12■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 CARS2-218ENST00000539269 795 ntTSL 328.4■■■□□ 2.144e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 CARS2-213ENST00000537394 720 ntTSL 526.94■■□□□ 1.94e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 CARS2-207ENST00000485188 756 ntTSL 321.32■■□□□ 14e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 CARS2-215ENST00000537412 570 ntTSL 419.7■□□□□ 0.744e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 CARS2-227ENST00000542126 567 ntTSL 419.54■□□□□ 0.724e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 CARS2-231ENST00000544488 575 ntTSL 419.54■□□□□ 0.724e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 CARS2-222ENST00000540629 531 ntTSL 418.8■□□□□ 0.64e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 CARS2-203ENST00000465145 748 ntTSL 514.38□□□□□ -0.114e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 CARS2-226ENST00000541443 574 ntTSL 58.16□□□□□ -1.14e-8■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.23e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 PAH-207ENST00000549111 1252 ntTSL 1 (best)7.21□□□□□ -1.263e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 NECAB3-205ENST00000473892 438 ntTSL 213.16□□□□□ -0.32e-12■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 PGGHG-208ENST00000529087 745 ntTSL 217.12■□□□□ 0.334e-15■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 RBMS1-211ENST00000477486 562 ntTSL 420.98■□□□□ 0.954e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 DLK1-204ENST00000555747 538 ntTSL 419.79■□□□□ 0.764e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.584e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 RIPOR1-218ENST00000566920 584 ntTSL 416.78■□□□□ 0.284e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 RIPOR1-208ENST00000562755 538 ntTSL 415.96■□□□□ 0.154e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 RIPOR1-207ENST00000562116 244 ntTSL 314.95□□□□□ -0.024e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 DLK1-203ENST00000392848 555 ntTSL 414.93□□□□□ -0.024e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 RIPOR1-213ENST00000566522 592 ntTSL 514.45□□□□□ -0.14e-6■□□□□ 8.6
PRPF4O43172 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.154e-6■□□□□ 8.6
Retrieved 100 of 20,551 protein–RNA pairs in 513.3 ms