Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VTI1BQ9UEU0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTI1BQ9UEU0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1BQ9UEU0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms