Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX15Q9NRS6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX15Q9NRS6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX15Q9NRS6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms