Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NIFKQ9BYG3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NIFKQ9BYG3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NIFKQ9BYG3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NIFKQ9BYG3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms