Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCGB1D4Q6XE38 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCGB1D4Q6XE38 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms