Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
COTL1Q14019 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COTL1Q14019 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms