Protein–RNA interactions for Protein: Q08641

ABP140, tRNA(Thr) (cytosine(32)-N(3))-methyltransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ABP140Q08641 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.02□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 VTC2YFL004W 2487 nt6.02□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 YKL031WYKL031W 414 nt6.02□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 ARR3YPR201W 1215 nt6.02□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 ROG3YFR022W 2202 nt6.02□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 SHO1YER118C 1104 nt6.01□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 MLC2YPR188C 492 nt6.01□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 GPT2YKR067W 2232 nt6.01□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 YME1YPR024W 2244 nt6.01□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 CST6YIL036W 1764 nt6.01□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 FAT3YKL187C 2253 nt6□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 ATP1YBL099W 1638 nt6□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 ERI1YPL096C-A 207 nt6□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 IME2YJL106W 1938 nt5.99□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 GUF1YLR289W 1938 nt5.99□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 VNX1YNL321W 2727 nt5.99□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 YAP1801YHR161C 1914 nt5.99□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 GAA1YLR088W 1845 nt5.99□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 PAP2YOL115W 1755 nt5.98□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 CIT3YPR001W 1461 nt5.98□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 VCX1YDL128W 1236 nt5.98□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 CDC11YJR076C 1248 nt5.98□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 DCN1YLR128W 810 nt5.98□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 HIR1YBL008W 2523 nt5.98□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 YJL193WYJL193W 1209 nt5.97□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 YBR226CYBR226C 411 nt5.97□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 MNN2YBR015C 1794 nt5.97□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 HSF1YGL073W 2502 nt5.97□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 GEX1YCL073C 1848 nt5.97□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 GEX2YKR106W 1848 nt5.97□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 ENT2YLR206W 1842 nt5.97□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 YEH1YLL012W 1722 nt5.96□□□□□ -1.45
ABP140Q08641 SIP2YGL208W 1248 nt5.96□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 MRPL36YBR122C 534 nt5.96□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 MSN2YMR037C 2115 nt5.96□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 MAL11YGR289C 1851 nt5.96□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 CLP1YOR250C 1338 nt5.96□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 ALT1YLR089C 1779 nt5.95□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 SMF2YHR050W 1650 nt5.95□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 RHB1YCR027C 630 nt5.95□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 YDL057WYDL057W 987 nt5.95□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 SPG4YMR107W 348 nt5.95□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 RSC30YHR056C 2652 nt5.94□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 BUL1YMR275C 2931 nt5.94□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 RNR3YIL066C 2610 nt5.94□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 YDR053WYDR053W 396 nt5.94□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 EFM4YIL064W 774 nt5.94□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 RSC2YLR357W 2670 nt5.93□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 ADY2YCR010C 852 nt5.93□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 SNZ3YFL059W 897 nt5.93□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 GFD1YMR255W 567 nt5.93□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 SNZ2YNL333W 897 nt5.93□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 MID1YNL291C 1647 nt5.92□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 QDR3YBR043C 2070 nt5.92□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 BRL1YHR036W 1416 nt5.92□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 RFA1YAR007C 1866 nt5.92□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 HCR1YLR192C 798 nt5.92□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 ASH1YKL185W 1767 nt5.92□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 HPF1YOL155C 2904 nt5.91□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 RRP46YGR095C 672 nt5.91□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 RDL2YOR286W 450 nt5.91□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.91□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 SET5YHR207C 1581 nt5.91□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 GUP2YPL189W 1830 nt5.9□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 IDP1YDL066W 1287 nt5.9□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.9□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 RBD2YPL246C 789 nt5.9□□□□□ -1.46
ABP140Q08641 PDC1YLR044C 1692 nt5.9□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 STL1YDR536W 1710 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 ARG1YOL058W 1263 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 PIN2YOR104W 849 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 RRT2YBR246W 1164 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 EIS1YMR031C 2532 nt5.89□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.88□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 TRP1YDR007W 675 nt5.88□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 COX26YDR119W-A 201 nt5.88□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 GIR2YDR152W 798 nt5.88□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 SFC1YJR095W 969 nt5.88□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 PGA3YML125C 939 nt5.88□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 CHL4YDR254W 1377 nt5.88□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 FLC3YGL139W 2409 nt5.88□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 TRK2YKR050W 2670 nt5.87□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 YGR176WYGR176W 348 nt5.87□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 RHO2YNL090W 579 nt5.87□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 DAL82YNL314W 768 nt5.87□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 YFL052WYFL052W 1398 nt5.87□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 SHE10YGL228W 1734 nt5.87□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 CDC16YKL022C 2523 nt5.86□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 ASF2YDL197C 1578 nt5.86□□□□□ -1.47
ABP140Q08641 UGO1YDR470C 1509 nt5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.9 ms