Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 YOR062CYOR062C 807 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 CTF19YPL018W 1110 nt6.78□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 CBP6YBR120C 489 nt6.78□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF3Q07807 RRP14YKL082C 1305 nt6.77□□□□□ -1.32
PUF3Q07807 CCT8YJL008C 1707 nt6.77□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YFT2YDR319C 825 nt6.77□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 AIM33YML087C 939 nt6.77□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 SCP1YOR367W 603 nt6.77□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 LDB16YCL005W 771 nt6.77□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 ILV6YCL009C 930 nt6.77□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 TEP1YNL128W 1305 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YDL119CYDL119C 924 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 PCL2YDL127W 927 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 ERP2YAL007C 648 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 MDE1YJR024C 735 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 AIM24YJR080C 1185 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YLR123CYLR123C 330 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YML094C-AYML094C-A 402 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YPL136WYPL136W 369 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 HFI1YPL254W 1467 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 DRN1YGR093W 1524 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 PCI8YIL071C 1335 nt6.76□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 RSP5YER125W 2430 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YHR112CYHR112C 1137 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YIL086CYIL086C 309 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 TIP41YPR040W 1071 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YPR177CYPR177C 372 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 IFA38YBR159W 1044 nt6.75□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 IMG1YCR046C 510 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 GRX6YDL010W 696 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YFL012WYFL012W 447 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 KSS1YGR040W 1107 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 HPM1YIL110W 1134 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 MHT1YLL062C 975 nt6.74□□□□□ -1.33 RIP-Chip
PUF3Q07807 YPR027CYPR027C 834 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 RRI1YDL216C 1323 nt6.74□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 ERG8YMR220W 1356 nt6.73□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 PRP46YPL151C 1356 nt6.73□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 IMG2YCR071C 441 nt6.73□□□□□ -1.33 RIP-Chip
PUF3Q07807 GTO1YGR154C 1071 nt6.73□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 MRPL6YHR147C 645 nt6.73□□□□□ -1.33 RIP-Chip
PUF3Q07807 EST3YIL009C-A 546 nt6.73□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 PSY3YLR376C 729 nt6.73□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 RPN8YOR261C 1017 nt6.73□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 SRL4YPL033C 846 nt6.73□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 ARE2YNR019W 1929 nt6.73□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 FET4YMR319C 1659 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YDR124WYDR124W 975 nt6.72□□□□□ -1.33 RIP-Chip
PUF3Q07807 YEA6YEL006W 1008 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YLR365WYLR365W 333 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 VMA6YLR447C 1038 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YNL217WYNL217W 981 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 RKI1YOR095C 777 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YOR111WYOR111W 699 nt6.72□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 MIF2YKL089W 1650 nt6.71□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 YPR204WYPR204W 3099 nt6.71□□□□□ -1.33
PUF3Q07807 SKY1YMR216C 2229 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 PEF1YGR058W 1008 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YLF2YHL014C 1218 nt6.71□□□□□ -1.34 RIP-Chip
PUF3Q07807 RHO3YIL118W 696 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YLL017WYLL017W 312 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YLL059CYLL059C 507 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 IES2YNL215W 963 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 COQ3YOL096C 939 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 DCI1YOR180C 816 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 ECM31YBR176W 939 nt6.71□□□□□ -1.34 RIP-Chip
PUF3Q07807 YGR054WYGR054W 1929 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 GPD2YOL059W 1323 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 PPT1YGR123C 1542 nt6.71□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 SLI1YGR212W 1407 nt6.7□□□□□ -1.34 RIP-Chip
PUF3Q07807 CDC8YJR057W 651 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 MEH1YKR007W 555 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YLR312CYLR312C 1197 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 URA4YLR420W 1095 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YOL166CYOL166C 339 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YSA1YBR111C 696 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 ARH1YDR376W 1482 nt6.7□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 SSU1YPL092W 1377 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 NFI1YOR156C 2181 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 HIM1YDR317W 1245 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 FIP1YJR093C 984 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YKR045CYKR045C 552 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 SEC65YML105C 822 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YPR153WYPR153W 423 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 UIP5YKR044W 1332 nt6.69□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 GYP8YFL027C 1494 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 BUD26YDR241W 288 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 PPE1YHR075C 1203 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 TIF2YJL138C 1188 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 TIF1YKR059W 1188 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YNL134CYNL134C 1131 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 ATP4YPL078C 735 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 EFM2YBR271W 1260 nt6.68□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 PTM1YKL039W 1572 nt6.68□□□□□ -1.34 RIP-Chip
PUF3Q07807 PTC3YBL056W 1407 nt6.67□□□□□ -1.34
PUF3Q07807 YDL026WYDL026W 312 nt6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.8 ms