Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC3P51654 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC3P51654 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC3P51654 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC3P51654 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC3P51654 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC3P51654 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC3P51654 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC3P51654 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GPC3P51654 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC3P51654 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC3P51654 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC3P51654 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC3P51654 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC3P51654 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC3P51654 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC3P51654 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC3P51654 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC3P51654 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC3P51654 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GPC3P51654 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC3P51654 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC3P51654 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC3P51654 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC3P51654 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC3P51654 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GPC3P51654 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC3P51654 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC3P51654 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC3P51654 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC3P51654 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC3P51654 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GPC3P51654 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC3P51654 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC3P51654 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GPC3P51654 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPC3P51654 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
GPC3P51654 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GPC3P51654 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC3P51654 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC3P51654 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GPC3P51654 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC3P51654 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC3P51654 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC3P51654 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC3P51654 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC3P51654 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GPC3P51654 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC3P51654 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC3P51654 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC3P51654 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC3P51654 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC3P51654 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GPC3P51654 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC3P51654 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC3P51654 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC3P51654 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC3P51654 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC3P51654 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC3P51654 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC3P51654 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GPC3P51654 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC3P51654 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC3P51654 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC3P51654 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC3P51654 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC3P51654 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC3P51654 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC3P51654 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC3P51654 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GPC3P51654 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC3P51654 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC3P51654 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC3P51654 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GPC3P51654 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC3P51654 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC3P51654 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC3P51654 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC3P51654 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC3P51654 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC3P51654 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC3P51654 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GPC3P51654 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC3P51654 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC3P51654 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC3P51654 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC3P51654 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GPC3P51654 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC3P51654 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC3P51654 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC3P51654 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC3P51654 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC3P51654 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC3P51654 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC3P51654 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GPC3P51654 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC3P51654 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC3P51654 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC3P51654 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GPC3P51654 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms