Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC2P49815 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC2P49815 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC2P49815 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC2P49815 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC2P49815 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC2P49815 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC2P49815 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC2P49815 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC2P49815 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC2P49815 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC2P49815 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC2P49815 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC2P49815 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC2P49815 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC2P49815 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC2P49815 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSC2P49815 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSC2P49815 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSC2P49815 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSC2P49815 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC2P49815 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC2P49815 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC2P49815 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC2P49815 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC2P49815 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC2P49815 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSC2P49815 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC2P49815 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC2P49815 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC2P49815 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC2P49815 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC2P49815 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC2P49815 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC2P49815 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC2P49815 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSC2P49815 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC2P49815 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC2P49815 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC2P49815 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSC2P49815 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC2P49815 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC2P49815 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSC2P49815 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC2P49815 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC2P49815 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC2P49815 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC2P49815 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC2P49815 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC2P49815 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC2P49815 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSC2P49815 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSC2P49815 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSC2P49815 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSC2P49815 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSC2P49815 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSC2P49815 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSC2P49815 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TSC2P49815 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSC2P49815 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC2P49815 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC2P49815 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC2P49815 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC2P49815 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSC2P49815 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC2P49815 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC2P49815 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC2P49815 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC2P49815 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC2P49815 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC2P49815 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC2P49815 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC2P49815 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC2P49815 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSC2P49815 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSC2P49815 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSC2P49815 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSC2P49815 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSC2P49815 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC2P49815 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC2P49815 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TSC2P49815 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC2P49815 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC2P49815 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC2P49815 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC2P49815 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC2P49815 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSC2P49815 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC2P49815 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC2P49815 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC2P49815 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC2P49815 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSC2P49815 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSC2P49815 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC2P49815 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC2P49815 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC2P49815 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC2P49815 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC2P49815 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSC2P49815 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms