Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 GYP1YOR070C 1914 nt6.21□□□□□ -1.42
VFA1P40080 AMD1YML035C 2433 nt6.2□□□□□ -1.42
VFA1P40080 ATF1YOR377W 1578 nt6.2□□□□□ -1.42
VFA1P40080 RRP4YHR069C 1080 nt6.2□□□□□ -1.42
VFA1P40080 ECM19YLR390W 339 nt6.2□□□□□ -1.42
VFA1P40080 CYC8YBR112C 2901 nt6.2□□□□□ -1.42
VFA1P40080 LYS21YDL131W 1323 nt6.2□□□□□ -1.42
VFA1P40080 ATG18YFR021W 1503 nt6.2□□□□□ -1.42
VFA1P40080 CSG2YBR036C 1233 nt6.19□□□□□ -1.42
VFA1P40080 ENV7YPL236C 1095 nt6.19□□□□□ -1.42
VFA1P40080 HAL1YPR005C 885 nt6.19□□□□□ -1.42
VFA1P40080 MLC2YPR188C 492 nt6.19□□□□□ -1.42
VFA1P40080 YME1YPR024W 2244 nt6.19□□□□□ -1.42
VFA1P40080 BPL1YDL141W 2073 nt6.19□□□□□ -1.42
VFA1P40080 PCL10YGL134W 1302 nt6.19□□□□□ -1.42
VFA1P40080 ALD6YPL061W 1503 nt6.19□□□□□ -1.42
VFA1P40080 SMC5YOL034W 3282 nt6.19□□□□□ -1.42
VFA1P40080 WHI4YDL224C 1950 nt6.18□□□□□ -1.42
VFA1P40080 ENT2YLR206W 1842 nt6.18□□□□□ -1.42
VFA1P40080 MTQ1YNL063W 945 nt6.18□□□□□ -1.42
VFA1P40080 ISY1YJR050W 708 nt6.17□□□□□ -1.42
VFA1P40080 YLR317WYLR317W 435 nt6.17□□□□□ -1.42
VFA1P40080 AAD15YOL165C 432 nt6.17□□□□□ -1.42
VFA1P40080 ODC2YOR222W 924 nt6.17□□□□□ -1.42
VFA1P40080 ATG12YBR217W 561 nt6.17□□□□□ -1.42
VFA1P40080 GUS1YGL245W 2127 nt6.16□□□□□ -1.42
VFA1P40080 RCK1YGL158W 1539 nt6.16□□□□□ -1.42
VFA1P40080 YCR006CYCR006C 474 nt6.16□□□□□ -1.42
VFA1P40080 SNF11YDR073W 510 nt6.16□□□□□ -1.42
VFA1P40080 DFM1YDR411C 1026 nt6.16□□□□□ -1.42
VFA1P40080 UGX2YDL169C 672 nt6.15□□□□□ -1.42
VFA1P40080 SEM1YDR363W-A 270 nt6.15□□□□□ -1.42
VFA1P40080 YEA6YEL006W 1008 nt6.15□□□□□ -1.42
VFA1P40080 SNZ3YFL059W 897 nt6.15□□□□□ -1.42
VFA1P40080 SFC1YJR095W 969 nt6.15□□□□□ -1.42
VFA1P40080 TAF4YMR005W 1167 nt6.15□□□□□ -1.42
VFA1P40080 YNL228WYNL228W 777 nt6.15□□□□□ -1.42
VFA1P40080 RFA2YNL312W 822 nt6.15□□□□□ -1.42
VFA1P40080 SNZ2YNL333W 897 nt6.15□□□□□ -1.42
VFA1P40080 YBR124WYBR124W 360 nt6.15□□□□□ -1.42
VFA1P40080 YNL247WYNL247W 2304 nt6.15□□□□□ -1.43
VFA1P40080 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.14□□□□□ -1.43
VFA1P40080 PRP46YPL151C 1356 nt6.14□□□□□ -1.43
VFA1P40080 DEF1YKL054C 2217 nt6.14□□□□□ -1.43
VFA1P40080 SIT4YDL047W 936 nt6.13□□□□□ -1.43
VFA1P40080 YIR043CYIR043C 693 nt6.13□□□□□ -1.43
VFA1P40080 CDC11YJR076C 1248 nt6.13□□□□□ -1.43
VFA1P40080 YMR027WYMR027W 1413 nt6.13□□□□□ -1.43
VFA1P40080 MRK1YDL079C 1506 nt6.13□□□□□ -1.43
VFA1P40080 SSK1YLR006C 2139 nt6.13□□□□□ -1.43
VFA1P40080 SVF1YDR346C 1446 nt6.12□□□□□ -1.43
VFA1P40080 PRS2YER099C 957 nt6.12□□□□□ -1.43
VFA1P40080 YFR006WYFR006W 1608 nt6.12□□□□□ -1.43
VFA1P40080 SIP2YGL208W 1248 nt6.12□□□□□ -1.43
VFA1P40080 YLR126CYLR126C 756 nt6.12□□□□□ -1.43
VFA1P40080 HIS7YBR248C 1659 nt6.12□□□□□ -1.43
VFA1P40080 MUM3YOR298W 1440 nt6.11□□□□□ -1.43
VFA1P40080 ISN1YOR155C 1353 nt6.11□□□□□ -1.43
VFA1P40080 YDL023CYDL023C 321 nt6.11□□□□□ -1.43
VFA1P40080 JJJ3YJR097W 519 nt6.11□□□□□ -1.43
VFA1P40080 YJU2YKL095W 837 nt6.11□□□□□ -1.43
VFA1P40080 HEM15YOR176W 1182 nt6.11□□□□□ -1.43
VFA1P40080 TIP41YPR040W 1071 nt6.11□□□□□ -1.43
VFA1P40080 YEF1YEL041W 1488 nt6.1□□□□□ -1.43
VFA1P40080 YPL245WYPL245W 1365 nt6.1□□□□□ -1.43
VFA1P40080 JIP4YDR475C 2631 nt6.1□□□□□ -1.43
VFA1P40080 SPO7YAL009W 780 nt6.1□□□□□ -1.43
VFA1P40080 RRT2YBR246W 1164 nt6.1□□□□□ -1.43
VFA1P40080 VPS72YDR485C 2388 nt6.1□□□□□ -1.43
VFA1P40080 VHT1YGR065C 1782 nt6.1□□□□□ -1.43
VFA1P40080 HEL1YKR017C 1656 nt6.1□□□□□ -1.43
VFA1P40080 TBF1YPL128C 1689 nt6.1□□□□□ -1.43
VFA1P40080 MPA43YNL249C 1629 nt6.1□□□□□ -1.43
VFA1P40080 SGE1YPR198W 1632 nt6.1□□□□□ -1.43
VFA1P40080 ORC5YNL261W 1440 nt6.09□□□□□ -1.43
VFA1P40080 PTR2YKR093W 1806 nt6.09□□□□□ -1.43
VFA1P40080 SRG1SRG1 551 nt6.09□□□□□ -1.43
VFA1P40080 RPS15YOL040C 429 nt6.09□□□□□ -1.43
VFA1P40080 PSH1YOL054W 1221 nt6.09□□□□□ -1.43
VFA1P40080 AIM17YHL021C 1398 nt6.08□□□□□ -1.44
VFA1P40080 BUL1YMR275C 2931 nt6.08□□□□□ -1.44
VFA1P40080 GUF1YLR289W 1938 nt6.08□□□□□ -1.44
VFA1P40080 ARP10YDR106W 855 nt6.08□□□□□ -1.44
VFA1P40080 MMS2YGL087C 414 nt6.08□□□□□ -1.44
VFA1P40080 BMT5YIL096C 1011 nt6.08□□□□□ -1.44
VFA1P40080 YPL102CYPL102C 303 nt6.08□□□□□ -1.44
VFA1P40080 EPS1YIL005W 2106 nt6.08□□□□□ -1.44
VFA1P40080 STL1YDR536W 1710 nt6.08□□□□□ -1.44
VFA1P40080 YOS9YDR057W 1629 nt6.07□□□□□ -1.44
VFA1P40080 TNA1YGR260W 1605 nt6.07□□□□□ -1.44
VFA1P40080 YCL065WYCL065W 369 nt6.07□□□□□ -1.44
VFA1P40080 RAI1YGL246C 1164 nt6.07□□□□□ -1.44
VFA1P40080 RHO2YNL090W 579 nt6.07□□□□□ -1.44
VFA1P40080 RSC2YLR357W 2670 nt6.07□□□□□ -1.44
VFA1P40080 MSN2YMR037C 2115 nt6.07□□□□□ -1.44
VFA1P40080 SFB3YHR098C 2790 nt6.06□□□□□ -1.44
VFA1P40080 GEX1YCL073C 1848 nt6.06□□□□□ -1.44
VFA1P40080 NOP7YGR103W 1818 nt6.06□□□□□ -1.44
VFA1P40080 GEX2YKR106W 1848 nt6.06□□□□□ -1.44
VFA1P40080 POP1YNL221C 2628 nt6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.7 ms