Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1P21675 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF1P21675 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF1P21675 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF1P21675 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1P21675 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1P21675 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1P21675 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1P21675 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF1P21675 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1P21675 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1P21675 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1P21675 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1P21675 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1P21675 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1P21675 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1P21675 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF1P21675 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF1P21675 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF1P21675 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF1P21675 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF1P21675 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF1P21675 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF1P21675 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF1P21675 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF1P21675 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF1P21675 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF1P21675 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF1P21675 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TAF1P21675 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
TAF1P21675 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
TAF1P21675 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF1P21675 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF1P21675 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF1P21675 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF1P21675 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF1P21675 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF1P21675 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF1P21675 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF1P21675 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1P21675 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1P21675 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1P21675 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1P21675 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF1P21675 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF1P21675 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF1P21675 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF1P21675 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF1P21675 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1P21675 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1P21675 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1P21675 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1P21675 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1P21675 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF1P21675 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1P21675 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1P21675 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1P21675 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF1P21675 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1P21675 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1P21675 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1P21675 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1P21675 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1P21675 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF1P21675 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1P21675 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1P21675 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1P21675 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1P21675 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1P21675 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1P21675 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TAF1P21675 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1P21675 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1P21675 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1P21675 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1P21675 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1P21675 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1P21675 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1P21675 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TAF1P21675 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1P21675 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1P21675 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1P21675 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TAF1P21675 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1P21675 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1P21675 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1P21675 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1P21675 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1P21675 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1P21675 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1P21675 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TAF1P21675 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1P21675 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1P21675 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1P21675 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TAF1P21675 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TAF1P21675 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TAF1P21675 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TAF1P21675 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TAF1P21675 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms