Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYT1P21579 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT1P21579 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT1P21579 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT1P21579 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT1P21579 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT1P21579 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYT1P21579 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT1P21579 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT1P21579 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT1P21579 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT1P21579 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT1P21579 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT1P21579 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT1P21579 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT1P21579 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT1P21579 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT1P21579 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYT1P21579 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYT1P21579 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYT1P21579 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYT1P21579 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYT1P21579 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYT1P21579 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYT1P21579 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYT1P21579 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYT1P21579 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYT1P21579 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYT1P21579 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYT1P21579 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYT1P21579 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SYT1P21579 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYT1P21579 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYT1P21579 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYT1P21579 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYT1P21579 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYT1P21579 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYT1P21579 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYT1P21579 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYT1P21579 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYT1P21579 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYT1P21579 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYT1P21579 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYT1P21579 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYT1P21579 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYT1P21579 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYT1P21579 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYT1P21579 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYT1P21579 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYT1P21579 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYT1P21579 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYT1P21579 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYT1P21579 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYT1P21579 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYT1P21579 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT1P21579 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT1P21579 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT1P21579 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT1P21579 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT1P21579 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT1P21579 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT1P21579 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYT1P21579 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYT1P21579 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYT1P21579 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYT1P21579 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYT1P21579 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYT1P21579 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYT1P21579 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYT1P21579 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYT1P21579 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYT1P21579 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYT1P21579 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYT1P21579 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYT1P21579 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SYT1P21579 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYT1P21579 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT1P21579 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT1P21579 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT1P21579 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT1P21579 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT1P21579 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT1P21579 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT1P21579 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT1P21579 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SYT1P21579 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYT1P21579 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYT1P21579 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SYT1P21579 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYT1P21579 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYT1P21579 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYT1P21579 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYT1P21579 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYT1P21579 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SYT1P21579 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYT1P21579 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYT1P21579 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYT1P21579 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SYT1P21579 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SYT1P21579 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms