Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEMFO60524 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEMFO60524 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEMFO60524 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEMFO60524 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEMFO60524 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEMFO60524 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEMFO60524 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEMFO60524 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEMFO60524 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEMFO60524 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEMFO60524 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEMFO60524 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEMFO60524 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEMFO60524 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEMFO60524 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEMFO60524 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEMFO60524 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEMFO60524 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEMFO60524 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEMFO60524 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEMFO60524 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEMFO60524 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEMFO60524 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEMFO60524 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEMFO60524 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEMFO60524 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEMFO60524 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEMFO60524 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEMFO60524 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NEMFO60524 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEMFO60524 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEMFO60524 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEMFO60524 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEMFO60524 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEMFO60524 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEMFO60524 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEMFO60524 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEMFO60524 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEMFO60524 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEMFO60524 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEMFO60524 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEMFO60524 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEMFO60524 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEMFO60524 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEMFO60524 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEMFO60524 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEMFO60524 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEMFO60524 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEMFO60524 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEMFO60524 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEMFO60524 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEMFO60524 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEMFO60524 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEMFO60524 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEMFO60524 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEMFO60524 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEMFO60524 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEMFO60524 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEMFO60524 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEMFO60524 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEMFO60524 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEMFO60524 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEMFO60524 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEMFO60524 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEMFO60524 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEMFO60524 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEMFO60524 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEMFO60524 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEMFO60524 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEMFO60524 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEMFO60524 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEMFO60524 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEMFO60524 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEMFO60524 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEMFO60524 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEMFO60524 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEMFO60524 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEMFO60524 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEMFO60524 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEMFO60524 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEMFO60524 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEMFO60524 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEMFO60524 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEMFO60524 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEMFO60524 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEMFO60524 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEMFO60524 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms