Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P7

ACBD3, Golgi resident protein GCP60, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD3Q9H3P7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACBD3Q9H3P7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACBD3Q9H3P7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACBD3Q9H3P7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms