Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CCDC136Q96JN2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CCDC136Q96JN2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCDC136Q96JN2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms