Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC9Q92623 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC9Q92623 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TTC9Q92623 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms