Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 ICT1YLR099C 1185 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 IFA38YBR159W 1044 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 PDR18YNR070W 4002 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 PAP2YOL115W 1755 nt5.93□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 HXK2YGL253W 1461 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 ARP10YDR106W 855 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 RPE1YJL121C 717 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 CDC11YJR076C 1248 nt5.92□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF2Q12221 RSC2YLR357W 2670 nt5.92□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF2Q12221 POP1YNL221C 2628 nt5.92□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 ENP1YBR247C 1452 nt5.91□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 VRP1YLR337C 2454 nt5.91□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 GUF1YLR289W 1938 nt5.91□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 MDH3YDL078C 1032 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 DON1YDR273W 1098 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 ATO3YDR384C 828 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 YDR401WYDR401W 564 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 APS3YJL024C 585 nt5.9□□□□□ -1.46 RIP-Chip
PUF2Q12221 CCP1YKR066C 1086 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 YPR123CYPR123C 435 nt5.9□□□□□ -1.46
PUF2Q12221 XBP1YIL101C 1944 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 IME2YJL106W 1938 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 AMD1YML035C 2433 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 HAP2YGL237C 798 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 RME1YGR044C 903 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 YMR147WYMR147W 672 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 SCO2YBR024W 906 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 YML082WYML082W 1950 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 ISC1YER019W 1434 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 CDC19YAL038W 1503 nt5.89□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 IMA5YJL216C 1746 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 YDL119CYDL119C 924 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 SEM1YDR363W-A 270 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 CIS3YJL158C 684 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 MRP17YKL003C 396 nt5.88□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 YGR127WYGR127W 939 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 COS6YGR295C 1146 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 LYS12YIL094C 1116 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 NPA3YJR072C 1158 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 MTC2YKL098W 1074 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 LST8YNL006W 912 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 DIA3YDL024C 1407 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 ORC5YNL261W 1440 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 GLE1YDL207W 1617 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 ERC1YHR032W 1746 nt5.87□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 KNS1YLL019C 2214 nt5.87□□□□□ -1.47 RIP-Chip
PUF2Q12221 GAT1YFL021W 1533 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 APM1YPL259C 1428 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 RPR2YIR015W 435 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 MRS1YIR021W 1092 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 MRPL22YNL177C 930 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 VMA4YOR332W 702 nt5.86□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 YPK2YMR104C 2034 nt5.86□□□□□ -1.47 RIP-Chip
PUF2Q12221 YCL065WYCL065W 369 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 YRA1YDR381W 681 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 YEA6YEL006W 1008 nt5.85□□□□□ -1.47 RIP-Chip
PUF2Q12221 THI4YGR144W 981 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 PAN6YIL145C 930 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 TAL1YLR354C 1008 nt5.85□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 MSN2YMR037C 2115 nt5.85□□□□□ -1.47 RIP-Chip
PUF2Q12221 ALT2YDR111C 1524 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 EFT2YDR385W 2529 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 EFT1YOR133W 2529 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 RPS2YGL123W 765 nt5.84□□□□□ -1.47 RIP-Chip
PUF2Q12221 YGR022CYGR022C 330 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 YKL031WYKL031W 414 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 STM1YLR150W 822 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 CSG2YBR036C 1233 nt5.84□□□□□ -1.47
PUF2Q12221 SHM1YBR263W 1473 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 SKI2YLR398C 3864 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 PRP46YPL151C 1356 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 OCA1YNL099C 717 nt5.83□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 ARR3YPR201W 1215 nt5.83□□□□□ -1.48 RIP-Chip
PUF2Q12221 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 DCN1YLR128W 810 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 HIS7YBR248C 1659 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 HSP78YDR258C 2436 nt5.82□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 YDR154CYDR154C 351 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 YER010CYER010C 705 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 YER186CYER186C 921 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 CBP4YGR174C 513 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 YJL107CYJL107C 1164 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 YNR068CYNR068C 819 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 YBR124WYBR124W 360 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 PYC1YGL062W 3537 nt5.81□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 LDB19YOR322C 2457 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 SIR2YDL042C 1689 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 COX9YDL067C 180 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 snR82snR82 268 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 KSS1YGR040W 1107 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 DEF1YKL054C 2217 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 AVT4YNL101W 2142 nt5.8□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 VPS4YPR173C 1314 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 IRS4YKR019C 1848 nt5.79□□□□□ -1.48
PUF2Q12221 LAG2YOL025W 1983 nt5.79□□□□□ -1.48
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