Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 SER2YGR208W 930 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 PEX18YHR160C 852 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 BET4YJL031C 984 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 APQ13YJL075C 417 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 CDC11YJR076C 1248 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 CWP2YKL096W-A 279 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 TEX1YNL253W 1269 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 TOM6YOR045W 186 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 ETT1YOR051C 1239 nt7.77□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 GND2YGR256W 1479 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YHL012WYHL012W 1482 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 SMP1YBR182C 1359 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 SCM3YDL139C 672 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 SED1YDR077W 1017 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 EMC4YGL231C 573 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 GIC1YHR061C 945 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 SML1YML058W 315 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 AIF1YNR074C 1137 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YOR292CYOR292C 930 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 BRR1YPR057W 1026 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 TRS20YBR254C 528 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 KAR4YCL055W 1008 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 ALR1YOL130W 2580 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 UBP13YBL067C 2244 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 STB3YDR169C 1542 nt7.76□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 MSS116YDR194C 1995 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 SES1YDR023W 1389 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 DAK2YFL053W 1776 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 PTC1YDL006W 846 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 VMA16YHR026W 642 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 MNN11YJL183W 1269 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 SPC34YKR037C 888 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 PML1YLR016C 615 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 PER33YLR064W 822 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 DUS4YLR405W 1104 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YOL118CYOL118C 309 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 MTG2YHR168W 1557 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 FET5YFL041W 1869 nt7.75□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 HEM14YER014W 1620 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 IWR1YDL115C 1062 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 HEM13YDR044W 987 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 TLG1YDR468C 675 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 CNN1YFR046C 1086 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 RFA3YJL173C 369 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 TOA2YKL058W 369 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YKL162CYKL162C 1209 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YAR053WYAR053W 297 nt7.74□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 Q0032Q0032 291 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 DET1YDR051C 1005 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 MRF1YGL143C 1242 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YHR173CYHR173C 339 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 CAB2YIL083C 1098 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 ADO1YJR105W 1023 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 POM33YLL023C 840 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 SAM1YLR180W 1149 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 REC102YLR329W 795 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YMR085WYMR085W 1299 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 SSO2YMR183C 888 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YOR111WYOR111W 699 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 TIF6YPR016C 738 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 ATG14YBR128C 1035 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 UMP1YBR173C 447 nt7.73□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 VPS62YGR141W 1404 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YDL086WYDL086W 822 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 RSM27YGR215W 333 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YJL215CYJL215C 360 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 YAR030CYAR030C 342 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 LSR1LSR1 1175 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 MED4YOR174W 855 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 HUT1YPL244C 1020 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 CTI6YPL181W 1521 nt7.72□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 IVY1YDR229W 1362 nt7.71□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 SPO23YBR250W 1572 nt7.71□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 TGL1YKL140W 1647 nt7.71□□□□□ -1.17
TY1A-BRQ12217 ARO3YDR035W 1113 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 YDR157WYDR157W 402 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 YER084W-AYER084W-A 513 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 SHO1YER118C 1104 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 VMA7YGR020C 357 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 AIM20YIL158W 615 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 NFU1YKL040C 771 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 SUR7YML052W 909 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 PRE6YOL038W 765 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 ALG14YBR070C 714 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 SUP45YBR143C 1314 nt7.71□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 YDR010CYDR010C 333 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 YDR282CYDR282C 1245 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 YIM1YMR152W 1098 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 YOL035CYOL035C 303 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 FIT1YDR534C 1587 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 AI4Q0065 1671 nt7.7□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 YRF1-2YER190W 5046 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 DUR3YHL016C 2208 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.69□□□□□ -1.18
TY1A-BRQ12217 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.69□□□□□ -1.18
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